Метапонт был основан в VII веке до н. э.
ахейцами, выходцами из Южной Греции (
Пилоса и
Мессинии). С самого начала своего существования город был вынужден вести войну с местными
италийскими племенами, которые сумели разрушить Метапонт. Колония была вновь отстроена при поддержке города
Сибарис. В конце VI века до н. э. в Метапонте жил
Пифагор Самосский, город был центром общины
пифагорейцев. В IV веке до н. э. колония вступила в конфликт с
Сиракузами, управляемыми тогда тираном
Дионисием I. Для противодействия экспансионистской политике последнего в Южной Италии Метапонт вступил в военный союз с другими городами
Великой Греции, однако после поражения союза в
389 году до н. э. в битве при Эллепоре вынужден был признать гегемонию Сиракуз. Во время войн с царём
Эпира
Пирром (280—275 г.г. до н. э.) Метапонт поддержал
Рим. После Тарентской войны (
272 год до н. э.) вошёл в состав Римского государства, однако после поражения римлян от
Ганнибала в битве при
Каннах в
216 году др н. э. перешёл на сторону
Карфагена. Вскоре, однако, власть Рима в Метапонте была восстановлена.