Шумакское месторождение появилось в результате тектонического разлома в известняках
протерозоя Тункинских гольцов, сформированных в конце неогенового, начале четвертичного периода (23-1,6 млн лет). Горные породы Тункинских гольцов — это
биотитовые, биотит-амфиболовые
гнейсы китойской серии с абсолютным возрастом более 1650 млн лет:
известняки,
доломиты,
песчаники, гравелиты,
конгломераты, отложившиеся на дне древнего океана 1650—400 млн лет назад и хранящие в себе остатки древнейшей жизни: трубочки водорослей, микрофитолиты,
строматолиты и
трилобиты. Среди них встречаются и вулканические породы существовавших в то время островных дуг и
стратовулканов. Поэтому Шумакские минеральные источники по праву считаются самыми молодыми источниками минеральных вод на планете.