Репаративная терапия, направленная на геев и лесбиянок, также применяется и для транссексуальных и трансгендерных пациентов, т.к. нетрадиционная гендерная идентичность или её расстройство рассматриваются меньшинством психологов как крайняя степень гомосексуальности. Хотя
шкала Бенджамина поддерживает эту точку зрения, современное научное сообщество отвергает подобную теорию.