Оставив Бухару в руинах, Чингисхан по долине Согдианы направился к Самарканду. Предатели открыли ему ворота и без боя сдали город. Так же поступили и в городе
Балхе. Но ни в том, ни в другом случае добровольная сдача не спасла жителей города от насилия и грабежа. Дальше Самарканда Чингисхан не пошёл, но отправил Толуя с семидесятитысячной армией на покорение
Хорасана. А два отряда во главе с Джебе и Субедеем-багатуром преследовали Мухаммеда, который скрылся в
Нишапуре. Проигравший войну и не имеющий поддержки
Мухаммед бежал к Каспийскому морю, где в прибрежной деревушке
Астара и умер от приступа пневмонии передав власть своему сыну
Джелал-ад-Дину.