Фактически представляет собой обширную систему проточных озёр, соединяемых многочисленными рукавами и протоками. В силу этого говорить об истоках, протяжённости, русле и т. п. можно лишь с достаточной степенью условности. Берёт начало из озера
Сайма (
Финляндия), расположенного на высоте 74 м над уровнем моря, и вскоре пересекает одну из конечных
ледниковых
морен — гряду
Салпаусселькя (финск. Salpausselkä), образуя в
Финляндии один из самых высоких водопадов в
Европе — водопад Иматра, где расположена одна из двух вуоксинских ГЭС на территории Финляндии. После пересечения границы с Россией реку преграждают ещё две
плотины гидроэлектростанций - (
Светогорской и Лесогорской). В районе посёлка барышево русло Вуоксы значительно расширяется, превращаясь в вытянутое озеро с неспешным течением, шириной до 2,5 км. Оно заканчивается возле посёлка
Лосево бурной Лосевской протокой, впадающей в
Суходольское озеро (длина 32 км, ширина 3—4 км). Незадолго до Лосево происходит разделение на северный и южный рукава Вуоксы - в основное русло с севера вливается Вуокса-вирта — протока, вытекающая из озера Балахановского. Южный рукав впадает в
Ладожское озеро возле посёлка Соловьёво полноводной и быстрой
рекой Бурной, начинающейся из Суходольского озера. Северный, после Балахановского озера, продолжается рядом озёр и мелководных проток, где происходит смена направления течения с южного на северное. В районе
Тиверского городища мелководные протоки заканчиваются, и северный рукав Вуоксы вновь становится полноводным озером. После посёлка
Васильево рукав делится на две узких быстрых протоки - Беличью и протоку, несущие свои воды мимо посёлка
Мельниково. Они впадают в обширное
озеро Вуокса, с многочисленными островами и заливами. Северный рукав делится на две протоки ещё раз - на основную, в черте города
Приозерска — более полноводную и бурную, длиной ок. 4,5 км, и малую, выходящий в Ладогу севернее — реку
Тихую, длина Тихой составляет 6 км. Обе протоки начинаются на восточной оконечности озера Вуокса.